L'IDDPNQL a été fondé en 2000 par l'APNQL pour soutenir les Premières Nations du Québec et du Labrador dans la réalisation de leur vision du développement durable. Il offre divers services en fonction des priorités et des enjeux identifiés localement par les 43 communautés autochtones. L'institut soutient la réalisation de projets favorisant le développement durable des communautés et des territoires, conseille techniquement l'APNQL sur ces questions, et promeut le respect des valeurs autochtones et la reconnaissance de leurs droits auprès des pouvoirs publics et autres organisations. Il développe des stratégies et des outils pour favoriser l'expertise et la prise de décision éclairée des Premières Nations, facilite le dialogue entre différentes organisations, et organise des ateliers et formations sur des enjeux d'intérêt pour les Premières Nations.